本作故事设定在与一代相同的时间点为征历1935年（也就是说本作是与战场的女武神第一作（PS3平台）处于同一个时代的全新故事），描绘了在架空的欧洲大陆上，夹在帝国与联邦两大势力中间的小国加利亚公国的战斗。在这场被后世称之为加利亚战役的战争中，一支被正规军当作处理烫手山芋问题的部队──加利亚公国422部队，成员都是由军队里的问题人物所组成。因故而被贬至这个部队队长克鲁特艾尔文，被当作死神嫌恶的莉艾拉玛鲁塞莉丝，以及背负著灭村仇恨的伊姆卡。在令人绝望的战场中，三位个性截然不同的主角，一支没有名字的部队，交织而成战场女武神三代的故事。